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便携式叶绿素分析仪由主机以及叶绿素传感器组成。叶绿素传感器是利用叶绿色素在光谱中有吸收峰和发射峰这一特性，在叶绿素的光谱吸收峰发射单色光照射到水中，水中的叶绿素吸收单色光的能量，释放出另外一种波长发射峰的单色光，叶绿素发射的光强与水中叶绿素的含量成正比。通过此方法来测定水中叶绿素的含量。
便携式蓝绿藻分析仪也叫藻类分析仪由主机以及蓝绿藻传感器组成。蓝绿藻传感器是利用蓝藻在光谱中有吸收峰和发射峰这一特性，发射特定波长的单色光照射到水中，水中的蓝藻吸收该单色光的能量，释放出另外一种波长的单色光，蓝绿藻发射的光强与水中蓝藻的含量成正比，通过此方法来测定水中蓝绿藻的含量。
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